承包工程合同签定不规范，工程结算计价难以确定。工程预算在审计过程中发现，建设、施工双方承包工程合同签订不规范。在签订合同时不按投标文件的内容逐一填写，尤其是建筑规模和中标价，存在少填或者不填的现象，给工程计价取费留下活口，目的是为了竣工后高报工程结算价格打下伏笔，使得原本十分严肃的合同失去约束作用，建设单位失去了对施工单位工程报价的有效监督，容易造成决算价格偏高。同时，给工程结算造价审核带来难度和风险。
施工单位施工过程中对技术资料的未能完整归档或有意不建档，造成建设单位在工程竣工后无法建立完整的工程资料档案并按要求报送工程结算所需资料，从而使审计工作周期拉长、风险加大。这个问题也的确存在。不过，按照一般的情况，审计周期是按提供完整的资料开始计算的。除非你自己的要求没有到位，那也怨不得别人。什么叫风险加大？是你审计费用不够用了吧？既然做了审计这个行业，就要有这个思想准备，否则人家建设单位为什么出钱给你啊！建设单位缺乏工程技术专管人员和工程技术专业知识或工程技术人员职业道德水准不高，造成工程项目施工中不合规的变更签证增多，从而使得工程预算随意增大。
工程预算的审核依据主要包括：
1、 有关工程建设和造价管理的法律、法规和方针政策。
2、施工图设计项目一览表、各专业施工图设计图纸和文字说明、工程地质勘察资料。
3、主管部门颁布的现行预算定额以及工程量清单计价规范。
4、施工组织设计或施工方案。
5、费用计算规则及取费标准。
6、预算工作手册或建材五金手册。
7、地区人工工资、材料及机械台班预算价格若有两次以上结算或签订两份以上合同产生两份以上结算时，在分次结算中要注意之前结算与之后结算的工程量衔接，之前结算一定要用文字或图示标（说）明已结范围和位置，之后结算要在结算前先核对之前各结算书已结时间段、位置和范围，避免重复。要求现场工程师在向成本控制中心报送资料中定要注明每次结算的实际施工位置或距离。
同时了解并熟悉这四个“新”，对于审核湖州工程预算，特别是审核按照这四个“新”设计出来的湖州湖州工程预算，更是非常重要。湖州工程预算审核人员不应满足于现有的知识水平，局限于只会看施工图、套预算定额、计算工程量，还应该了解并熟悉整个施工过程，熟悉每个项目所包括的工程内容和施工工序，才能较好地完成湖州工程预算审核的任务。建设单位内部各职能部门之间只有经常互相通气，交换意见，才能搞好审核湖州工程预算的工作湖州工程预算审核管理部门及工作人员一要参加技术交底和工程验收，二要参与设计变更和经济洽商，三要参与制订材料采购计划，四要加强与财务部门的联系。仔细阅读并理解招标文件及设计图纸施工招标作为业主选择工程项目施工单位的手段，一般均要求投标人的标书要地响应招标文件的要求，预算报价也不例外。在阅读招标文件时，对招标文件中工程量清单项目的组成及包含的内容、套用定额的要求必须明确，否则容易造成报价偏离业主，或者与其他投标人的报价差距较大而出围或者成为废标。另外，在报价前要充分理解施工设计图纸，列出图纸中的所有项目，并将图纸中工程数量重新计算与清单相比，以供不平衡报价参考，特别注意其中的现状地面标高、设计地面标高、地质报告等内容，这些直接影响土方的数量、软基处理数量，对总体报价影响较大。