工程预算审计主要针对工程项目决算的，在一个建设项目竣工完成，建设单位与施工单位结算工程款时进行的。工程预算审计就是工程预算审核（审价），是工程预算咨询单位咨询业务的一部分。受业主委托对其工程项目的概算、预算及结算等，依据现行 政策法规、计价依据及相关工程技术资料对送审造价的工程量、单价及取费等进行逐项审核。在运用工程量清单计价模式进行工程预算审计工作时，可以从以下几个方面来进行：
工程造价员和工程预算员的区别如下：
一、工作性质不同预算员是在工程施工前对工程的投资进行预算工作，造价员是工程完工以后对工程的实际产生的费用进行造价咨询（工程预算审计）工作。造价员也可从事预算工作，但预算员不能从事造价咨询工作。
二、工作单位不同预算员一般是在施工企业工作，造价员一般是在造价咨回询企业工作
三、不同预算员是省建设厅印制的，由省建设厅颁发。造价员是中国造价咨询协会（中价协）的，是省造价管理总站颁发。
工程预算的竣工具体要求：
1、工程已达到甲方竣工要求。
2、各个系统的功能说明，设备配备情况，以及图例配备齐全，达到完整的竣工资料。
如何搞好竣工结算：
1、企业领导的重视。
2、编制人员具备各种工程的规范。
3、商签公平合同条款，为结算编制提供必要条件。
4、编制者的主动性与积极性是编好结算的保证。
5、收复相关资料，为结算编制提供充分的依据。
工程预算计价的依据
1)工程预算定额:A预算定额B概算定额；
2)造价指标:A概算指标；B投资估算指标；C万元指标；
3)取费定额:A其他直接费定额；B现场经费定额；C间接费定额；D工程建设其他费用定额；E建筑安装工程计划利润率；
4)工期定额:A建设工期；B施工工期；
5)基础单价:A劳动力的单位价格:B材料单位价格；C施工机械台班单价；D设备费单价；
6)工程预算指数