工程预算中的工程结算审核，以施工承包合同为基础．以承发包双方发生的实物交易为依据，按照 或地方施工工、料、机消耗标准进行核算，对双方有约束力。其工程结算审核结果可作为双方结算的法律依据。审计定义为：由独立的机构和人员检查被审计单位的会计凭证、会计帐本、会计报表以及其他与财政收支、财务收支有关资料和资产，监督财政收支、财务收支是否真实、合法和有效的行为。审计的目的是加强对公有制投资者资金进行有效的控制，减少投资者滥用职权截留资金，转移资金于小金库，造成建设资金流失，实施违法违规行为。其职能是一种监督行为。
工程预算设计部门应当加强以下几个方面的工作：
1）工程预算项目的设计单要严把质量关，保证所提交的工程设计具有较高的质量；
2）应当明确职责并与奖金挂钩，发挥绩效的积极作用；
3）应当有计划有目标地培养技术骨干，通过请专家来对企业员工进行培训、单位工程竣工验收程序：工程竣工验收由建设单位组织勘察、工程预算编制、施工、监理等单位和其他有关方面的专家进行工程验收。（1）单位工程完工后，施工单位自行组织检查评定，并向建设单位提出交工验收投告。（2）建设单位收到工程验收报告后，应由建设单位（项目）负责人组织施工（合分包单位）、工程预算编制、监理等单位（项目）负责人进行单位（子单位）工程验收。
工程预算增加工程是“猫腻”较多的地方，究其原因，主要是设计单位设计深度不够，建设单位责任心不强。有些承包商在“低价中标法”中不计成本得到工程后，为了弥补损失，千方百计增加工程签证，在利益诱惑下，某些项目管理者乱签证、补签证现象严重 ，审计人员一旦认真复核，通常会发现签证工程量与实际出入较大。安装、装饰及园林工程结算取定的材料单价和市场行情出入很大，有的甚至“偷梁换柱”。例如某国产灯具安装材料套用进口材料价格，工地现场的名贵树种规格和结算书的规格大相径庭，通过现场勘查取证 ，工程预算水分被大大挤压出来。
对于设备采办费用以及安装费用的审核。在材料及设备的采办费用的审核上需要注意联系实际市场上费用的变化以及以往的相关或是类似的工程建设的市场调查价格、设备采办价格以及设计院的预估价格、供应商的报价等方面进行。并且要依据设计图纸上的信息审核设备数量，从而结合这种种进行设备采办费用的审核。另外，对于设备安装费用的审核需要依据适用指标、定额、类似浙江工程预算指标、取费标准以及所需辅助材料的实际市场价格进行。务必保证设备采办费用以及安装费用的审核工作的仔细、，避免由于设备所涉及的单个费用太多而造成的遗漏或重复现象的出现。依据 相关的法律法规对工程浙江工程预算文件中的内容特别是程序性条款进行认真、细致的核实，检查其是否与 和地方招投标法律、法规的规定一致，并注意其评标办法与开标顺序的公平性。同时要对浙江工程预算文件中的相关计价条款进行审核，审核的目的是：确保计价条款的完整性以及明确性。审核的标准包括：浙江工程预算范围及界定、总包与相应分包的合同关系、标段的划分浙江工程预算控制价的说明、水电费的计价方式、指定分包工程内容及其计价方式、工程变更签证的结算方式、材料设备采供方式及相应计价方式、工程进度款的结算方式、承担风险的内容范围以及超出约定范围和幅度的调整办法、工程预付款的约定、合同类型及工程浙江工程预算的有关约定、返还方式以及质量保证金的比例等。
